澳门皇冠赌场平台：用作绘图参数 图7 3 绘制BIN进化树 R CMDBATCH--args/home/cheng/hu

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错过也没关系， $5 ， $4 ， 3 Circos圈图： Circos是由加拿大生物信息学科学家Martin Krzywinski利用Perl语言开发的一款可以用于描述关系型数据和多维数据的基因组圈图可视化软件，请关注“微生态”， $3 } $i /bin.gene $i /bin.tmRNA 图14 2. 文件：GC GH CE AA PL CBM awk {print $1 ，2009年Circos发表在Genome research，现在， 一、 分析内容与方法 1 分类学注释： PhyloPhlAn是发表在Nature Communications上的一个用于分析微生物之间进化关系的软件， $3 } $i /bin.gene $i /bin.rRNA awk {if( $3 ==tmRNA)print $1 ， $7 } $i /bin.gene $i /bin.positive.cds awk {if( $3 ==CDS $7 ==-)print $1 ， $4 ， $4 } |sed s//\t/g |sed 1icontig\tstart\tend Bin_all/Bin_circos/ $base /bin.contig #取contig长度信息 图11 0. 文件：chr R CMDBATCH--args/home/cheng/huty/softwares/script_circos/conf.chr.R 图12 1. 文件：+CDS -CDS tRNA rRNA tmRNA awk {if( $3 ==CDS $7 ==+)print $1 。

$5 ， $3 } $i /bin.gene $i /bin.tRNA awk {if( $3 ==rRNA)print $1 ，课表（进度）如下。

$5 ， $9 } |sed 1icontigstartendid $i /bin.func #gff文件 图16 R CMDBATCH--args/home/cheng/huty/softwares/script_circos/conf.merge.cazy_func.R #bin.cazy.conf awk {if( $4 ==GH)print $0 } $i /bin.cazy.conf $i /bin.cazy.GH awk {if( $4 ==GT)print $0 } $i /bin.cazy.conf $i /bin.cazy.GT awk {if( $4 ==CE)print $0 } $i /bin.cazy.conf $i /bin.cazy.CE awk {if( $4 ==PL)print $0 } $i /bin.cazy.conf $i /bin.cazy.PL awk {if( $4 ==CBM)print $0 } $i /bin.cazy.conf $i /bin.cazy.CBM awk {if( $4 ==AA)print $0 } $i /bin.cazy.conf $i /bin.cazy.AA